广州序科码生物技术有限责任公司
主营产品:单细胞测序
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产品介绍
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延伸拓展
产品详情:数学程序揭示细胞拷贝数变异
表面上相似的细胞通常有明显不同的基因组,比如这通常在癌细胞中比较常见,在小型的肿 瘤样本中表面上看起来相似的癌细胞或许存在完全不同的基因组,细胞中的遗传突变通常会以断断续续破裂的模式来进行扩散,单一细胞中的拷贝数变异(Copy Number Variations,CNV)通常或将帮助制定特殊的疗法体系。
近日,刊登在国际杂志Nature上的一项研究论文中,来自冷泉港的科学家们进行了一项名为“银杏”(Gingko)的新型互作分析程序,这可以减少对单一细胞分析所带来的不确定性,并且为清楚分析多种细胞的拷贝数变异提供方法;这种新型的开放性软件在网上就可以免费获取,其可以帮助科学家研究多种类型遗传性疾病的并机制,并且帮助临床医生制定基于细胞特殊突变的靶向性疗法。
突变有多种形式,比如在为常见类型的突变中,单个个体或细胞中的突变往往会发生在DNA序列的单一位点上;而另一种常见的突变则为拷贝数变异;文章中研究者分析了来自大量肿 瘤样本中的拷贝数变异,Michael Schatz教授表示,你或许会认为肿 瘤中的每一个细胞都是相同的,但实际上并不是这样。我们同产会认为在单一肿 瘤细胞中发生这许多改变,如果我们对癌 症进行治疗,就需要准确诊断个体的癌 症类型,而且同时利用多种不同药物来靶向作用不同癌 症亚型或许也可以有效抑制癌 症发展。
当前探究拷贝数变异的强大的单细胞分析技术就是全基因组测序,在测序进行之前细胞中的DNA已经被放大了很多倍,而该过程会充满错误,而且一些随意的DNA模块也会被放大;文章中研究者利用自动化程序对测序数据进行处理,绘制出了相关的基因组的序列,并且为每一个细胞都创建了拷
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